3.2 偏置激励模块
首页界面点击"MPI_Toolbox",然后选择"Focal Modulation",进入偏置激励页面。跳转出磁粒子生成模拟图形。
选取不同的磁粒子类型,包含切比雪夫多项式类型(理想磁粒子,链式粒子,郎之万粒子),模拟仿真类型(郎之万粒子,德拜弛豫粒子)。
选取磁粒子的特性参数,包括磁粒子的粒径,粘度,温度,弛豫时间,链式粒子的矫顽力。
选取激励磁场的参数,包括交变磁场强度,交变磁场频率,直流偏置磁场强度1和2,直流偏置信号的比例因子Dog factor。
选取显示的变量类型,包括谐波次数,谐波类型(幅值、相位、实部、虚部)。
选取后处理参数,包括仿体图像,信噪比,视野FOV大小,正交梯度磁场大小。
下部为结果展示区,第一列是谐波图谱,信号半峰全宽随直流偏置场的变化,两次直流偏置场下的点扩散函数PSF和它们的相减结果。
第二列是两次直流偏置场下的2维点扩散图片和它们的相减图片,图片对应的半峰全宽也显示在图片上。
第三列是半峰全宽随谐波次数的变化曲线,选择的仿体也展示出来。
第4列是两次直流偏置场下的1维度成像系统矩阵SM和它们相减的结果SM。
第5和6列是两次直流偏置场下的信号,第5列无噪声,第6列添加了噪声,第三行是系统矩阵SM的奇异值分解结果和根据截断SVD进行的重建图像关联系数。
第7列是两次直流偏置场下的线条仿体重建图像,最大关联系数对应的重建结果被高亮显示。
4.1MPI-CT融合与3D重建
根据dicom文件进行三维重建界面:首页界面点击"Open Picture"然后选择"Database se",选择需要进行重建的dicom文件,得到三维重建的图像。
在选择并生成CT重建图像后,选择"Modify single",将进入三维图像重建界面。
可调参数:界面左侧展示了一系列可调参数,包括最大阈值与最小阈值、图像缩放、对象索引、颜色条、平滑度与透明度、套索分割与区域增长、点线面三种绘制图像的方法。您可以通过滑动按钮或选择按钮实时调整这些参数的大小,并选择需要的展示效果。
以下是可调参数,它们位于界面的左侧。这些参数可以通过滑动按钮实时调整:
位于页面左侧上方的"Min threshold"和"Max threshold"可以调整重建图像的阈值范围,并显示需要展示的组织、骨骼或内脏区域,在界面右侧会展示扫描的不同断层的CT图像;"Zoom"可以调整重建后的三维图像的大小。
"Object index"包含在重建图像中标记的不同对象,使用颜色条为对象添加颜色后,可根据颜色不同显示出不同的区域;"Smoothness"和"Transparency"可以调整重建图像的平滑度和透明度。
界面中间部分显示了重建后的图像,界面右侧部分显示了横断面、冠状位、失状位的CT扫描图像,帮助您更好地观察通过CT扫描得到的样本。
在选择并生成三维重建图像后,通过区域选择,将重点区域突出显示。
可选参数:界面左侧展示了一系列可选参数,包括区域分割方式、重建图像展示方式。
"Lasso segmentation"和"Region grow"选择要分割区域,分割后的区域对应一个索引对象,并有相应的颜色表示,可以通过"Object index"选择需要的对象.用户可根据需要选择需要展示的部分,并通过点击索引对象对应的色块按钮选择显示或隐藏该部分。
"Points","Lines" 和"Filled"选择描绘三维图像的方法,包括点、线、面三种展示方式。
在选择并生成CT重建图像后,点击"Compare Image"并选择需要分析的磁粒子CT扫描文件,然后选择"Modify single",将进入三维图像重建与磁粒子分布分析界面。
位于页面左侧下方的"Min threshold"和"Max threshold"可以调整显示MPI的阈值范围,突出显示某一部分的磁粒子分布;调节后的磁粒子将在三维重建页面中重建,可以观察磁粒子在样本体内的分布位置。
MPI分布图像:界面右侧显示了横断面、冠状面、失状面的CT图像中的MPI分布,通过调节阈值按钮,可以观察磁粒子在样本体内的分布。也可以直接点击右侧图像中的位置,得到不同断层图片的展示结果。
当MPI图像与CT图像对准发生偏移时,通过x轴、y轴、z轴对称变化以及移动可以调整MPI磁粒子分布位置。
阈值选择完成后,通过"fuision"展示MPI 信号与CT 图像的融合结果,将界面向最右侧拖动获取结果,得到小鼠体内磁粒子分布的横断面、冠状面、失状面图像,同时图片文件已自动存入原始文件夹中。
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